A Modifier Screen for Bazooka/PAR-3 Interacting Genes in the Drosophila Embryo Epithelium
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The development and homeostasis of multicellular organisms depends on sheets of epithelial cells. Bazooka (Baz; PAR-3) localizes to the apical circumference of epithelial cells and is a key hub in the protein interaction network regulating epithelial structure. We sought to identify additional proteins that function with Baz to regulate epithelial structure in the Drosophila embryo. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: The baz zygotic mutant cuticle phenotype could be dominantly enhanced by loss of known interaction partners. To identify additional enhancers, we screened molecularly defined chromosome 2 and 3 deficiencies. 37 deficiencies acted as strong dominant enhancers. Using deficiency mapping, bioinformatics, and available single gene mutations, we identified 17 interacting genes encoding known and predicted polarity, cytoskeletal, transmembrane, trafficking and signaling proteins. For each gene, their loss of function enhanced adherens junction defects in zygotic baz mutants during early embryogenesis. To further evaluate involvement in epithelial polarity, we generated GFP fusion proteins for 15 of the genes which had not been found to localize to the apical domain previously. We found that GFP fusion proteins for Drosophila ASAP, Arf79F, CG11210, Septin 5 and Sds22 could be recruited to the apical circumference of epithelial cells. Nine of the other proteins showed various intracellular distributions, and one was not detected. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: Our enhancer screen identified 17 genes that function with Baz to regulate epithelial structure in the Drosophila embryo. Our secondary localization screen indicated that some of the proteins may affect epithelial cell polarity by acting at the apical cell cortex while others may act through intracellular processes. For 13 of the 17 genes, this is the first report of a link to baz or the regulation of epithelial structure.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».