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Enregistrement W2112546055 · doi:10.1128/mcb.02450-05

Oxidative Stress-Activated Zinc Cluster Protein Stb5 Has Dual Activator/Repressor Functions Required for Pentose Phosphate Pathway Regulation and NADPH Production

2006· article· en· W2112546055 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensMcGill UniversityRoyal Victoria HospitalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University Health CentreMcGill University
Mots-clésPentose phosphate pathwayBiologyRepressorActivator (genetics)BiochemistryOxidative stressCell biologySaccharomyces cerevisiaeGeneRegulation of gene expressionChromatin immunoprecipitationOxidative phosphorylationGene expressionPromoterEnzymeGlycolysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Saccharomyces cerevisiae, zinc cluster protein Pdr1 can form homodimers as well as heterodimers with Pdr3 and Stb5, suggesting that different combinations of these proteins may regulate the expression of different genes. To gain insight into the interplay among these regulators, we performed genome-wide location analysis (chromatin immunoprecipitation with hybridization to DNA microarrays) and gene expression profiling. Unexpectedly, we observed that Stb5 shares only a few target genes with Pdr1 or Pdr3 in rich medium. Interestingly, upon oxidative stress, Stb5 binds and regulates the expression of most genes of the pentose phosphate pathway as well as of genes involved in the production of NADPH, a metabolite required for oxidative stress resistance. Importantly, deletion of STB5 results in sensitivity to diamide and hydrogen peroxide. Our data suggest that Stb5 acts both as an activator and as a repressor in the presence of oxidative stress. Furthermore, we show that Stb5 activation is not mediated by known regulators of the oxidative stress response. Integrity of the pentose phosphate pathway is required for the activation of Stb5 target genes but is not necessary for the increased DNA binding of Stb5 in the presence of diamide. These data suggest that Stb5 is a key player in the control of NADPH production for resistance to oxidative stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle