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Enregistrement W2112578960 · doi:10.1128/aem.72.4.2707-2720.2006

Pseudomonad Cyclopentadecanone Monooxygenase Displaying an Uncommon Spectrum of Baeyer-Villiger Oxidations of Cyclic Ketones

2006· article· en· W2112578960 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Catalysis and Immobilization
Établissements canadiensNational Research Council CanadaBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMonooxygenaseStereochemistryEnzymeChemistryBaeyer–Villiger oxidationOxidoreductaseAmino acidBiochemistryCytochrome P450

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Baeyer-Villiger monooxygenases (BVMOs) are biocatalysts that offer the prospect of high chemo-, regio-, and enantioselectivity in the organic synthesis of lactones or esters from a variety of ketones. In this study, we have cloned, sequenced, and overexpressed in Escherichia coli a new BVMO, cyclopentadecanone monooxygenase (CpdB or CPDMO), originally derived from Pseudomonas sp. strain HI-70. The 601-residue primary structure of CpdB revealed only 29% to 50% sequence identity to those of known BVMOs. A new sequence motif, characterized by a cluster of charged residues, was identified in a subset of BVMO sequences that contain an N-terminal extension of approximately 60 to 147 amino acids. The 64-kDa CPDMO enzyme was purified to apparent homogeneity, providing a specific activity of 3.94 micromol/min/mg protein and a 20% yield. CPDMO is monomeric and NADPH dependent and contains approximately 1 mol flavin adenine dinucleotide per mole of protein. A deletion mutant suggested the importance of the N-terminal 54 amino acids to CPDMO activity. In addition, a Ser261Ala substitution in a Rossmann fold motif resulted in an improved stability and increased affinity of the enzyme towards NADPH compared to the wild-type enzyme (K(m) = 8 microM versus K(m) = 24 microM). Substrate profiling indicated that CPDMO is unusual among known BVMOs in being able to accommodate and oxidize both large and small ring substrates that include C(11) to C(15) ketones, methyl-substituted C(5) and C(6) ketones, and bicyclic ketones, such as decalone and beta-tetralone. CPDMO has the highest affinity (K(m) = 5.8 microM) and the highest catalytic efficiency (k(cat)/K(m) ratio of 7.2 x 10(5) M(-1) s(-1)) toward cyclopentadecanone, hence the Cpd designation. A number of whole-cell biotransformations were carried out, and as a result, CPDMO was found to have an excellent enantioselectivity (E > 200) as well as 99% S-selectivity toward 2-methylcyclohexanone for the production of 7-methyl-2-oxepanone, a potentially valuable chiral building block. Although showing a modest selectivity (E = 5.8), macrolactone formation of 15-hexadecanolide from the kinetic resolution of 2-methylcyclopentadecanone using CPDMO was also demonstrated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,540

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle