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Enregistrement W2112579429 · doi:10.1073/pnas.0401406101

The <i>Spn4</i> gene of <i>Drosophila</i> encodes a potent furin-directed secretory pathway serpin

2004· article· en· W2112579429 sur OpenAlexafffund
Martin J. Richer, Clairessa A. Keays, Jennifer Waterhouse, Jessey Minhas, Carl Hashimoto, François Jean

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchHealth CanadaNational Institutes of HealthLouisiana State University
Mots-clésSerpinFurinSerine proteaseSerine Proteinase InhibitorsSerineBiologyProteaseProteasesBiochemistryDrosophila melanogasterProprotein convertaseCleavage (geology)Protease inhibitor (pharmacology)Molecular biologyEnzymeGeneGeneticsVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proprotein convertases (PCs) are an important class of host-cell serine endoproteases implicated in many physiological and pathological processes. Owing to their expanding roles in the proteolytic events required for generating infectious microbial pathogens and for tumor growth and invasiveness, there is increasing interest in identifying endogenous PC inhibitors. Here we report the identification of Spn4A, a previously uncharacterized secretory pathway serine protease inhibitor (serpin) from Drosophila melanogaster that contains a consensus furin cleavage site, -Arg(P4)-Arg-Lys-Arg(P1) downsream-, in its reactive site loop (RSL). Our biochemical and kinetics analysis revealed that recombinant Spn4A inhibits human furin (K(i), 13 pM; k(ass), 3.2 x 10(7) M(-1) x s(-1)) and Drosophila PC2 (K(i), 3.5 nM; k(ass), 9.2 x 10(4) M(-1) x s(-1)) by a slow-binding mechanism characteristic of serpin molecules and forms a kinetically trapped SDS-stable complex with each enzyme. For both PCs, the stoichiometry of inhibition by Spn4A is nearly 1, which is characteristic of known physiological serpin-protease interactions. Mass analysis of furin-Spn4A reaction products identified the actual reactive site center of Spn4A to be -Arg(P4)-Arg-Lys-Arg(P1)-downstream-. Moreover, we demonstrate that Spn4A's highly effective PC inhibition properties are critically dependent on the unusual length of its RSL, which is composed of 18 aa instead of the typical 17-residue RSL found in most other inhibitory serpins. The identification of Spn4A, the most potent and effective natural serpin of PCs identified to date, suggests that Spn4A could be a prototype of endogenous serpins involved in the precise regulation of PC-dependent proteolytic cleavage events in the secretory pathway of eukaryotic cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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