Development of a simple model for studying the effects of antifungal agents on multicellular communities of Aspergillus fumigatus
Notice bibliographique
Résumé
Aspergillus fumigatus is an increasingly prevalent opportunistic fungal pathogen of various immunocompromised individuals. It has the ability to form filaments within the lungs, producing dense intertwined mycelial balls, which are difficult to treat. The aim of this study was to develop a suitable model of A. fumigatus to examine the effects of antifungal challenge on these intertwined filamentous communities. A. fumigatus NCPF 7367 growth conditions were optimized on both Thermanox coverslips and on flat-bottomed microtitre plates to establish optimal conidial seeding densities. Isolates were treated with itraconazole, voriconazole, amphotericin B and caspofungin and their overall killing efficiency was measured using an XTT formazan metabolic dye assay. This was compared with the CLSI (formerly NCCLS) methodology of broth microdilution of moulds (standard M38-A). It was shown that 1x10(5) conidia ml(-1) in RPMI 1640 was the optimum concentration of spores for biofilm formation. Filamentous growth characteristics were not observed until 10 h incubation, followed by an exponential increase in the biofilm biomass (hyphae and extracellular material) and cellular activity (metabolism). When susceptibility testing of biofilms was compared with that of planktonic cells by CLSI broth microdilution testing, all antifungal drugs were at least 1000 times less effective at reducing the overall metabolic activity of 90 % of the cells. Overall, this study showed that A. fumigatus has the ability to form coherent multicellular biofilm structures that are resistant to the effects of antifungal drugs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».