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Enregistrement W2112762027 · doi:10.1088/0031-9155/60/13/5007

A study of potential numerical pitfalls in GPU-based Monte Carlo dose calculation

2015· article· en· W2112762027 sur OpenAlexafffund
Vincent Magnoux, Benoı̂t Ozell, Éric Bonenfant, Philippe Després

Notice bibliographique

RevuePhysics in Medicine and Biology · 2015
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAdvanced Radiotherapy Techniques
Établissements canadiensCentre hospitalier universitaire de QuébecUniversité LavalPolytechnique Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaElektaCompute Canada
Mots-clésMonte Carlo methodComputer scienceBenchmark (surveying)RoundingTracking (education)VoxelFraction (chemistry)AlgorithmCode (set theory)Computational scienceStatisticsMathematicsArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The purpose of this study was to evaluate the impact of numerical errors caused by the floating point representation of real numbers in a GPU-based Monte Carlo code used for dose calculation in radiation oncology, and to identify situations where this type of error arises. The program used as a benchmark was bGPUMCD. Three tests were performed on the code, which was divided into three functional components: energy accumulation, particle tracking and physical interactions. First, the impact of single-precision calculations was assessed for each functional component. Second, a GPU-specific compilation option that reduces execution time as well as precision was examined. Third, a specific function used for tracking and potentially more sensitive to precision errors was tested by comparing it to a very high-precision implementation. Numerical errors were found in two components of the program. Because of the energy accumulation process, a few voxels surrounding a radiation source end up with a lower computed dose than they should. The tracking system contained a series of operations that abnormally amplify rounding errors in some situations. This resulted in some rare instances (less than 0.1%) of computed distances that are exceedingly far from what they should have been. Most errors detected had no significant effects on the result of a simulation due to its random nature, either because they cancel each other out or because they only affect a small fraction of particles. The results of this work can be extended to other types of GPU-based programs and be used as guidelines to avoid numerical errors on the GPU computing platform.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,053
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,053
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,112
Tête enseignante GPT0,405
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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