Transcriptional Transitions during <i>Dictyostelium</i> Spore Germination
Notice bibliographique
Résumé
Many protozoa form spores in response to adversity; therefore, spore germination is a key process in their life cycle. Dictyostelium discoideum sporulates in response to starvation following a developmental program. Germination is characterized by two visible changes, spore swelling and the emergence of amoeba from the spore capsule. Several studies have indicated that an additional process termed spore activation is also required, but the physiological changes that characterize the three phases are largely uncharacterized. We used microarrays to monitor global transcriptional transitions as a surrogate measure of the physiological changes that occur during germination. Using two independent methods to induce germination, we identified changes in mRNA levels that characterized the germination process rather than changes that resulted from the induction method. We found that germination is characterized by three transitions. The first transition occurs during activation, while the spores appear dormant, the largest transition occurs when swelling begins, and the third transition occurs when emergence begins. These findings indicate that activation and swelling are not passive occurrences, such as dilution of inhibitors or spore rehydration, but are active processes that are accompanied by dramatic events in mRNA degradation and de novo transcription. These findings confirm and extend earlier reports that genes such as celA are regulated during spore germination. We also found by mutation analysis that the unconventional myosin gene myoI, which is induced during early germination, plays roles in the maintenance of dormancy and in spore swelling. This finding suggests that some of the observed transcriptional changes are required for spore germination.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».