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Enregistrement W2112910931 · doi:10.1093/clinchem/47.2.195

Quantitative Real-Time Reverse Transcription-PCR Assay for Cyclin D1 Expression: Utility in the Diagnosis of Mantle Cell Lymphoma

2001· article· en· W2112910931 sur OpenAlexaff
Karen E. Bijwaard, Nadine S. Aguilera, Yury Monczak, Michel Trudel, Jeffery K. Taubenberger, Jack Lichy

Notice bibliographique

RevueClinical Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCyclin D1Mantle cell lymphomaReal-time polymerase chain reactionCancer researchBiologyMolecular biologyReverse transcription polymerase chain reactionLymph nodeCyclinCyclin DLymphomaGeneGene expressionCell cycleImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The t(11;14)(q13;q32) translocation present in the majority of mantle cell lymphomas (MCLs) places the cyclin D1 gene under the control of immunoglobulin transcriptional regulatory elements, causing overexpression of cyclin D1. Quantification of cyclin D1 expression can distinguish MCL from other lymphomas. METHODS: A quantitative real-time reverse transcription (RT)-PCR assay was developed for cyclin D1 mRNA suitable for use with RNA extracted from fresh and formalin-fixed, paraffin-embedded tissues. Specimens were amplified in an Applied Biosystems Model 7700 Sequence Detection System in reactions containing primers and probes for cyclin D1 and a control gene, beta(2)-microglobulin. Relative expression of the two genes was standardized against a control MCL cell line, M02058. RESULTS: The range of cyclin D1 expression among 20 MCLs was substantially higher than that in other lymphomas and reactive lymph nodes. By choosing an optimal cutoff point for assessing overexpression, the sensitivity and specificity of the assay for the diagnosis of MCL in lymph node specimens both approached 100%: Overexpression was detected in 20 of 20 MCLs, but in none of 21 non-mantle-cell lymphomas or 10 reactive lymph nodes. CONCLUSIONS: Quantitative real-time RT-PCR for cyclin D1 overexpression provides a rapid diagnostic test with clinical utility in the diagnosis of MCL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,450
Score d'incertitude au seuil0,524

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations119
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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