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Enregistrement W2112983644 · doi:10.1136/gut.2009.183707

Dietary folate, alcohol and B vitamins in relation to LINE-1 hypomethylation in colon cancer

2009· article· en· W2112983644 sur OpenAlexfundno aff
Eva Schernhammer, Edward Giovannucci, Bernard Rosner, Shuji Ogino

Notice bibliographique

RevueGut · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthGary Bennett Family FundNational Institute for Health and Care ResearchEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentColorectal Cancer AllianceEntertainment Industry Foundation
Mots-clésColorectal cancerAlcoholFolic acidCancerMedicineInternal medicineMethylationGastroenterologyOncologyBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND AIMS: Although critical for methylation reactions, how dietary folate and B vitamins affect global DNA methylation level in colorectal cancers is currently unknown. Long interspersed nucleotide element-1 (LINE-1) is an emerging indicator of genome-wide DNA methylation level that has previously been linked to colon cancer survival. METHODS: We examined the association between dietary intake of folate, alcohol and B vitamins and LINE-1 hypomethylation in 609 incident colon cancers, utilising the database of two independent prospective cohort studies. RESULTS: Participants with > or = 400 microg folate intake per day were significantly less likely to develop LINE-1 hypomethylated colon cancers than those reporting <200 microg of folate intake per day (RR=0.57, 95% CI=0.36 to 0.91 for <55% LINE-1 methylated colon tumours; RR=0.74, 95% CI=0.51 to 1.06 for 55-64% LINE-1 methylated colon tumours; and RR=1.08, 95% CI=0.66 to 1.75 for > or = 65% LINE-1 methylated tumours; P(interaction)=0.01). By contrast, high alcohol consumption conferred a higher risk of LINE-1 hypomethylated cancers (> or = 15 g alcohol per day versus none, RR=1.67, 95% CI=1.04 to 2.67 for <55% LINE1 methylated tumours; and RR=1.55, 95% CI=1.10 to 2.18 for 55-64% LINE-1 methylated tumours) but had no association with > or = 65% LINE-1 methylated tumours (RR=1.06, 95% CI=0.69 to 1.62). High intakes of vitamin B(6), B(12) or methionine were not significantly associated with colon cancers, regardless of LINE-1 methylation level. CONCLUSION: The influence of dietary folate intake and alcohol consumption on colon cancer risk differs significantly according to tumoral LINE-1 methylation level.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,864
Score d'incertitude au seuil0,337

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations163
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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