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Enregistrement W2113176563 · doi:10.1111/j.1567-1364.2009.00497.x

<i>ETP1/YHL010c</i>is a novel gene needed for the adaptation of<i>Saccharomyces cerevisiae</i>to ethanol

2009· article· en· W2113176563 sur OpenAlexafffund
Christopher Snowdon, Ryan Schierholtz, Peter Poliszczuk, Stephanie L. Hughes, George van der Merwe

Notice bibliographique

RevueFEMS Yeast Research · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsUniversity of Guelph
Mots-clésSaccharomyces cerevisiaeBiologyAdaptation (eye)EthanolSaccharomycesGeneGeneticsComputational biologyBiochemistryNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Saccharomyces cerevisiae has the ability to use a variety of different carbon sources to support its growth. Abundant fermentable sugars such as glucose and fructose are metabolized to ethanol that accumulates in the environment. Upon glucose depletion, nonfermentable carbon sources, such as ethanol and glycerol, are sufficient to support growth. However, high ethanol concentrations inhibit yeast growth and can become toxic to the cell. Here we show that YHL010c, a previously uncharacterized gene of S. cerevisiae, is needed by the yeast to adapt to ethanol, either as a sole carbon source or as a stressor. We named the gene ETP1 (Ethanol Tolerance Protein 1) and show that the etp1Delta strain has a growth defect in the presence of ethanol, ETP1 is needed for the ethanol-induced transcriptional activation of the ENA1 promoter and heat shock protein genes (HSP12 and HSP26), and plays a role in ethanol-induced turnover of the low-affinity hexose transporter Hxt3p. In addition, the hypersensitivity of etp1Delta to ethanol stress is partly due to the inability of the mutant to control the level of the cation/H(+) antiporter Nha1p in the cell.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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