PB2 and Hemagglutinin Mutations Are Major Determinants of Host Range and Virulence in Mouse-Adapted Influenza A Virus
Notice bibliographique
Résumé
Serial mouse lung passage of a human influenza A virus, A/Hong Kong/1/68 (H3N2) (HK-wt), produced a mouse-adapted variant, MA, with nine mutations that was >10(3.8)-fold more virulent. In this study, we demonstrate that MA mutations of the PB2 (D701N) and hemagglutinin (HA) (G218W in HA1 and T156N in HA2) genes were the most adaptive genetic determinants for increased growth and virulence in the mouse model. Recombinant viruses expressing each of the mutated MA genome segments on the HK-wt backbone showed significantly increased disease severity, whereas only the mouse-adapted PB2 gene increased virulence, as determined by the 50% lethal dose ([LD(50)] >10(1.4)-fold). The converse comparisons of recombinant MA viruses expressing each of the HK-wt genome segments showed the greatest decrease in virulence due to the HA gene (10(2)-fold), with lesser decreases due to the M1, NS1, NA, and PB1 genes (10(0.3)- to 10(0.8)-fold), and undetectable effects on the LD(50) for the PB2 and NP genes. The HK PB2 gene did, however, attenuate MA infection, as measured by weight loss and time to death. Replication of adaptive mutations in vivo and in vitro showed both viral gene backbone and host range effects. Minigenome transcription assays showed that PB1 and PB2 mutations increased polymerase activity and that the PB2 D701N mutation was comparable in effect to the mammalian adaptive PB2 E627K mutation. Our results demonstrate that host range and virulence are controlled by multiple genes, with major roles for mutations in PB2 and HA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».