Single-molecule DNA detection with an engineered MspA protein nanopore
Pourquoi ce travail est-il dans la base ?
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.
Scores machine (provisoires)
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
- Écart entre enseignants
- 0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
- Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline· tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle
Résumé
Nanopores hold great promise as single-molecule analytical devices and biophysical model systems because the ionic current blockades they produce contain information about the identity, concentration, structure, and dynamics of target molecules. The porin MspA of Mycobacterium smegmatis has remarkable stability against environmental stresses and can be rationally modified based on its crystal structure. Further, MspA has a short and narrow channel constriction that is promising for DNA sequencing because it may enable improved characterization of short segments of a ssDNA molecule that is threaded through the pore. By eliminating the negative charge in the channel constriction, we designed and constructed an MspA mutant capable of electronically detecting and characterizing single molecules of ssDNA as they are electrophoretically driven through the pore. A second mutant with additional exchanges of negatively-charged residues for positively-charged residues in the vestibule region exhibited a factor of approximately 20 higher interaction rates, required only half as much voltage to observe interaction, and allowed ssDNA to reside in the vestibule approximately 100 times longer than the first mutant. Our results introduce MspA as a nanopore for nucleic acid analysis and highlight its potential as an engineerable platform for single-molecule detection and characterization applications.
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La notice
- Revue
- Proceedings of the National Academy of Sciences
- Thématique
- Nanopore and Nanochannel Transport Studies
- Domaine
- Engineering
- Établissements canadiens
- —
- Organismes subventionnaires
- National Human Genome Research InstituteNational Institutes of HealthUniversity of British Columbia
- Mots-clés
- NanoporeBiophysicsMoleculeMutantDNAChemistryMycobacterium smegmatisPorinNanopore sequencingNanotechnologyMaterials scienceBacterial outer membraneBiochemistryBiologyDNA sequencing
- Résumé présent dans OpenAlex
- oui