MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2113306639 · doi:10.1371/journal.pgen.1002607

Novel Loci for Adiponectin Levels and Their Influence on Type 2 Diabetes and Metabolic Traits: A Multi-Ethnic Meta-Analysis of 45,891 Individuals

2012· review· en· W2113306639 sur OpenAlexafffund
Zari Dastani, Marie‐France Hivert, Nicholas J. Timpson, John R. B. Perry, Xin Yuan, Robert A. Scott, Peter Henneman, Iris M. Heid, Jorge R. Kizer, Leo‐Pekka Lyytikäinen, Christian Fuchsberger, Toshiko Tanaka, Andrew P. Morris, Kerrin S. Small, Aaron Isaacs, Marian Beekman, Stefan Coassin, Kurt Lohman, Lu Qi, Stavroula Kanoni, James S. Pankow, Hae‐Won Uh, Ying Wu, Aurelian Bidulescu, Laura J. Rasmussen‐Torvik, Celia M.T. Greenwood, Jonna Grimsby, Ching‐Ti Liu, Jaspal S. Kooner, Vincent Mooser, Péter Vollenweider, Karen Kapur, John C. Chambers, Nicholas J. Wareham, Claudia Langenberg, Rune R. Frants, Ko Willems van Dijk, Ben A. Oostra, Sara M. Willems, Claudia Lamina, Thomas W Winkler, Bruce M. Psaty, Russell P. Tracy, Jennifer A. Brody, Ida Chen, Jorma Viikari, Mika Kähönen, Peter P. Pramstaller, David M. Evans, Beaté St Pourcain, Naveed Sattar, Andrew R. Wood, Stefania Bandinelli, Olga D. Carlson, Josephine M. Egan, Stefan Böhringer, Lyudmyla Kedenko, Kati Kristiansson, Marja-Liisa Nuotio, Britt-Marie Loo, Tamara Harris, Melissa García, Alka M. Kanaya, Margot Haun, Norman Klopp, H.‐Erich Wichmann, Panos Deloukas, E. A. Katsareli, David Couper, Bruce Bartholow Duncan, M. Kloppenburg, Linda S. Adair, Judith B. Borja, James G. Wilson, Solomon K. Musani, Xiuqing Guo, Toby Johnson, Robert K. Semple, Tanya M. Teslovich, Matthew Allison, Susan Redline, Sarah G. Buxbaum, Karen L. Mohlke, Ingrid Meulenbelt, Christie M. Ballantyne, George Dedoussis, Frank B. Hu, Bernhard Paulweber, Timothy D. Spector, P. Eline Slagboom, Luigi Ferrucci, Antti Jula, Markus Perola, Olli T. Raitakari, Jose C. Florez, Veikko Salomaa, Johan G. Eriksson, Timothy M. Frayling, Andrew A. Hicks, Terho Lehtimäki, George Davey Smith, David S. Siscovick, Florian Kronenberg, Cornelia M. van Duijn, Ruth J. F. Loos, Dawn Waterworth, James B. Meigs, Josée Dupuis, J. Brent Richards

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2012
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipokines, Inflammation, and Metabolic Diseases
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Center for Advancing Translational SciencesWellcome TrustNational Human Genome Research InstituteBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesFogarty International CenterNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingNational Institute for Health and Care ResearchCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthBritish Heart Foundation
Mots-clésBiologyAdiponectinType 2 diabetesEthnic groupMeta-analysisGeneticsInternal medicineDiabetes mellitusEndocrinologyBioinformaticsInsulin resistanceAnthropologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Circulating levels of adiponectin, a hormone produced predominantly by adipocytes, are highly heritable and are inversely associated with type 2 diabetes mellitus (T2D) and other metabolic traits. We conducted a meta-analysis of genome-wide association studies in 39,883 individuals of European ancestry to identify genes associated with metabolic disease. We identified 8 novel loci associated with adiponectin levels and confirmed 2 previously reported loci (P = 4.5×10(-8)-1.2×10(-43)). Using a novel method to combine data across ethnicities (N = 4,232 African Americans, N = 1,776 Asians, and N = 29,347 Europeans), we identified two additional novel loci. Expression analyses of 436 human adipocyte samples revealed that mRNA levels of 18 genes at candidate regions were associated with adiponectin concentrations after accounting for multiple testing (p<3×10(-4)). We next developed a multi-SNP genotypic risk score to test the association of adiponectin decreasing risk alleles on metabolic traits and diseases using consortia-level meta-analytic data. This risk score was associated with increased risk of T2D (p = 4.3×10(-3), n = 22,044), increased triglycerides (p = 2.6×10(-14), n = 93,440), increased waist-to-hip ratio (p = 1.8×10(-5), n = 77,167), increased glucose two hours post oral glucose tolerance testing (p = 4.4×10(-3), n = 15,234), increased fasting insulin (p = 0.015, n = 48,238), but with lower in HDL-cholesterol concentrations (p = 4.5×10(-13), n = 96,748) and decreased BMI (p = 1.4×10(-4), n = 121,335). These findings identify novel genetic determinants of adiponectin levels, which, taken together, influence risk of T2D and markers of insulin resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,013
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,242
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,128 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations510
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS GeneticsMême sujetAdipokines, Inflammation, and Metabolic DiseasesTravaux en français237 207