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Enregistrement W2113311312 · doi:10.1113/jphysiol.2003.051631

Syntaxin 1A Co‐Associates with Native Rat Brain and Cloned Large Conductance, Calcium‐Activated Potassium Channels <i>in situ</i>

2003· article· en· W2113311312 sur OpenAlexafffund
Shizhang Ling, Jian‐Zhong Sheng, Janice E.A. Braun, Andrew P. Braun

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physiology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Heritage Foundation for Medical ResearchYale UniversityHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésSyntaxinCell biologyImmunoprecipitationHEK 293 cellsChemistryCalcium-activated potassium channelSyntaxin 3Potassium channelBiologyMembrane proteinBiophysicsBiochemistryReceptorMembraneGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Large conductance, calcium-activated potassium channels (BKCa channels) are regulated by several distinct mechanisms, including phosphorylation/dephosphorylation events and protein-protein interactions. In this study, we have examined the interaction between BKCa channels and syntaxin 1A, a soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptor (SNARE) that is reported to modulate the activity and/or localization of different classes of ion channels. Using a reciprocal co-immunoprecipitation strategy, we observed that native BKCa channels in rat hippocampus co-associate with syntaxin 1A, but not the closely related homologue syntaxin 3. This BKCa channel-syntaxin 1A interaction could be further demonstrated in a non-neuronal cell line (human embryonic kidney (HEK) 293 cells) following co-expression of rat syntaxin 1A and BKCa channels cloned from either mouse brain or bovine aorta. However, co-expression of these same channels with syntaxin 3 did not lead to a detectable protein-protein interaction. Immunofluorescent co-staining of HEK 293 cells expressing BKCa channels and syntaxin 1A demonstrated overlapping distribution of these two proteins in situ. Functionally, co-expression of BKCa channels with syntaxin 1A, but not syntaxin 3, was observed to enhance channel gating and kinetics at low concentrations (1-4 microM) of free cytosolic calcium, but not at higher concentrations (< or = 10 microM), as judged by macroscopic current recordings in excised membrane patches. Interactions between BKCa channels and neighbouring membrane proteins may thus play important roles in regulating the activity and/or distribution of these channels within specialized cellular compartments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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