The D3 Bacteriophage α-Polymerase Inhibitor (Iap) Peptide Disrupts O-Antigen Biosynthesis through Mimicry of the Chain Length Regulator Wzz in Pseudomonas aeruginosa
Notice bibliographique
Résumé
Lysogenic bacteriophage D3 causes seroconversion of Pseudomonas aeruginosa PAO1 from serotype O5 to O16 by inverting the linkage between O-specific antigen (OSA) repeat units from α to β. The OSA units are polymerized by Wzy to modal lengths regulated by Wzz1 and Wzz2. A key component of the D3 seroconversion machinery is the inhibitor of α-polymerase (Iap) peptide, which is able to solely suppress α-linked long-chain OSA production in P. aeruginosa PAO1. To establish the target specificity of Iap for Wzyα, changes in OSA phenotypes were examined via Western immunoblotting for wzz1 and wzz2 single-knockout strains, as well as a wzz1 wzz2 double knockout, following the expression of iap from a tuneable vector. Increased induction of Iap expression completely abrogated OSA production in the wzz1 wzz2 double mutant, while background levels of OSA production were still observed in either of the single mutants. Therefore, Iap inhibition of OSA biosynthesis was most effective in the absence of both Wzz proteins. Sequence alignment analyses revealed a high degree of similarity between Iap and the first transmembrane segment (TMS) of either Wzz1 or Wzz2. Various topology prediction analyses of the Iap sequence consistently predicted the presence of a single TMS, suggesting a propensity for Iap to insert itself into the inner membrane (IM). The compromised ability of Iap to abrogate Wzyα function in the presence of Wzz1 or Wzz2 provides compelling evidence that inhibition occurs after Wzyα inserts itself into the IM and is achieved through mimicry of the first TMS from the Wzz proteins of P. aeruginosa PAO1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».