Synthesis of Building Blocks and Oligonucleotides with {G}O<sup>6</sup>‐Alkyl‐O<sup>6</sup>{G} Cross‐Links
Notice bibliographique
Résumé
This unit describes two methods for preparing oligonucleotides containing an O(6)-2'-deoxyguanosine-alkyl-O(6)-2'-deoxyguanosine interstrand cross-link by a solid-phase synthesis approach. Depending on the desired orientation of the cross-link in the DNA duplex, either a bis- or a mono-phosphoramidite synthesis strategy can be employed. Both procedures require the preparation of a protected 2'-deoxyguanosine-containing dimer where the two nucleosides are attached at the O(6)-atoms by an alkyl linker. This linker is introduced as a protected diol using two successive Mitsunobu reactions to produce a cross-linked amidite that is incorporated into an oligonucleotide via solid-phase synthesis. The use of a protected diol lends versatility to this method, as cross-links of variable chain length may be prepared. The bis-phosphoramidite approach is a direct method to preparing the cross-linked duplex, whereas the mono-phosphoramidite strategy requires additional manipulation of the solid support to prepare cross-linked oligonucleotides. Once all synthetic steps are completed, these oligonucleotides can then be removed from the solid support and deprotected, and then purified via ion-exchange HPLC to produce sufficient quantities of substrates that can be used in DNA repair studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».