Novel Retinoid Targets in the Mouse Limb during Organogenesis
Notice bibliographique
Résumé
Bioactive retinoids are potent limb teratogens, upregulating apoptosis, decreasing chondrogenesis, and producing limb-reduction defects. To target the origins of these effects, we examined gene expression changes in the developing murine limb after 3 h of culture with teratogenic concentrations of vitamin A. Embryonic day 12 CD-1 limbs were cultured in the absence or presence of vitamin A (retinol acetate) at 1.25 and 62.5muM (n = 5). Total RNA was used to probe Atlas 1.2 cDNA arrays. Eighty-one genes were significantly upregulated by retinol exposure; among these were key limb development signaling molecules, extracellular matrix and adhesion proteins, oncogenes, and a large number of transcriptional regulators, including Eya2, Id3, Snail, and Hes1. To relate these expression changes to teratogenic outcome, the response of these four genes was assessed after culture with vitamin A and retinoid receptor antagonists that are able to rescue retinoid-induced malformations; expression levels were correlated with limb malformations. Lastly, pathways analysis revealed that a large number of the genes significantly affected by retinoid treatment are functionally linked through direct interactions. Several regulatory gene cascades emerged relevant to morphogenesis, cell-fate, and chondrogenesis; moreover, members of these cascades crosstalk with one other. These results indicate that retinoids act in a coordinated fashion to disrupt development at multiple levels. In sum, this work proposes several unifying mechanisms for retinoid-induced limb malformations, identifies novel retinoid targets, and highlights Eya2, Id3, Snail, and Hes1 as potential key teratogenic effectors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».