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Enregistrement W2113450006 · doi:10.1111/j.1537-2995.2012.03754.x

The low‐prevalence Rh antigen STEM (RH49) is encoded by two different RHCE*ce818T alleles that are often in cis to <i>RHD</i>*<i>DOL</i>

2012· article· en· W2113450006 sur OpenAlexaff
Marion E. Reid, Christine Halter Hipsky, Kim Hue‐Roye, Gail Coghlan, Coral Olsen, Christine Lomas‐Francis

Notice bibliographique

RevueTransfusion · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésAlleleAntigenRh blood group systemBiologyPhenotypeGenotypeGeneticsMolecular biologyAntibodyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: STEM (RH49) is a low-prevalence antigen in the Rh blood group system. A scarcity of anti-STEM has precluded extensive study of this antigen. We report that two alleles with a RHCE*ce818C>T change encode a partial e, and a hr(S) -, hr(B) +, STEM+ phenotype and that both alleles are frequently in cis to RHD*DOL1 or RHD*DOL2. STUDY DESIGN AND METHODS: Blood samples were from donors and patients in our collections. Hemagglutination, DNA, and RNA testing was performed by standard techniques. RESULTS: Fourteen STEM+ samples were heterozygous RHCE*ce818C/T: six had RHCE*ceBI and eight had a novel allele, RHCE*ceSM. Eleven were heterozygous for RHD*DOL1 or RHD*DOL2. Eleven samples, previously typed STEM-, had RHCE*ce818C/C (consensus nucleotide). RBCs from informative STEM+ samples were e+/- hr(S) - hr(B) +. One person who was heterozygous RHCE*ceBI and RHCE*cE had an anti-e-like antibody in her plasma, and one person, who was hemizygous for RHD*DOL2, had anti-D in her plasma. CONCLUSIONS: We show that two alleles with a RHCE*ce818C>T change (RHCE*ceBI and RHCE*ceSM) encode a hr(S) - hr(B) + STEM+ phenotype. In addition, both alleles are frequently in cis to RHD*DOL1 or RHD*DOL2 and RHCE*ceBI encodes a partial e antigen. In the small cohort of samples tested, RHD*DOL invariably traveled with RHCE*ce818T. Our study also confirmed the presumption that RHD*DOL2, like RHD*DOL1, encodes a partial D antigen and the low-prevalence antigen DAK.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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