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Enregistrement W2113472792 · doi:10.1152/ajpcell.00168.2008

Collagen phagocytosis is regulated by the guanine nucleotide exchange factor Vav2

2008· article· en· W2113472792 sur OpenAlexafffund
Pamma D. Arora, Paola A. Marignani, Christopher A. McCulloch

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Cell Physiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGuanine nucleotide exchange factorPhagocytosisGuanineNucleotideCell biologyChemistryBiologyBiochemistryGTPaseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Collagen phagocytosis is a crucial alpha2beta1-integrin-dependent process that mediates extracellular matrix remodeling by fibroblasts. We showed previously that after initial contact with collagen, activated Rac1 accelerates collagen phagocytosis but the Rac guanine nucleotide exchange factors (GEFs) that regulate Rac are not defined. We examined here the GEFs that regulate collagen phagocytosis in mouse fibroblasts. Collagen binding enhanced Rac1 activity (5-20 min) but not Cdc42 or RhoA activity. Analysis of collagen bead-associated proteins showed enrichment with Vav2, which correlated temporally with increased Rac1 activity. Knockdown of Vav2 prevented Rac activation, recruitment of Rac1 to collagen bead binding sites, and collagen bead binding, but knockdown of Sos-1 or beta-Pix had no effect on Rac activation or collagen binding. Vav2 was associated with the nucleotide-free Rac1 mutant (G15ARac1) after collagen binding. Collagen bead binding promoted phosphorylation of Vav2, which temporally correlated with Rac1 activation and which required Src kinase activity. Blockage of Src activity prevented collagen bead-induced Rac activation and collagen bead binding. Collectively these data indicate that Vav2 regulates the Rac1 activity associated with the binding step of collagen phagocytosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,115
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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