Transcriptional Profiles in the Cerebral Hemisphere of Chicken Embryos Following In Ovo Perfluorohexane Sulfonate Exposure
Notice bibliographique
Résumé
In a recent egg injection study, we showed that in ovo exposure to perfluorohexane sulfonate (PFHxS) affects the pipping success of developing chicken (Gallus gallus domesticus) embryos. We also found evidence of thyroid hormone (TH) pathway interference at multiple levels of biological organization (i.e., somatic growth, messenger RNA expression, and circulating free thyroxine levels). Based on these findings, we hypothesize that PFHxS exposure interferes with TH-dependent neurodevelopmental pathways. This study investigates global transcriptional profiles in cerebral hemispheres of chicken embryos following exposure to a solvent control, 890 or 38,000 ng PFHxS/g egg (n = 4-5 per group); doses that lead to the adverse effects indicated above. PFHxS significantly alters the expression (≥ 1.5-fold, p ≤ 0.001) of 11 transcripts at the low dose (890 ng/g) and 101 transcripts at the high dose (38,000 ng/g). Functional enrichment analysis shows that PFHxS affects genes involved in tissue development and morphology, cellular assembly and organization, and cell-to-cell signaling. Pathway and interactome analyses suggest that genes may be affected through several potential regulatory molecules, including integrin receptors, myelocytomatosis viral oncogene, and CCAAT/enhancer-binding protein. This study identifies key functional and regulatory modes of PFHxS action involving TH-dependent and -independent neurodevelopmental pathways. Some of these TH-dependent mechanisms that occur during embryonic development include tight junction formation, signal transduction, and integrin signaling, whereas TH-independent mechanisms include gap junction intercellular communication.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».