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Enregistrement W2113568392 · doi:10.1002/lno.10149

Copepod carcasses as microbial hot spots for pelagic denitrification

2015· article· en· W2113568392 sur OpenAlexaff
Ronnie N. Glud, Hans‐Peter Grossart, Morten Larsen, Kam W. Tang, Kristine Engel Arendt, Søren Rysgaard, Bo Thamdrup, Torkel Gissel Nielsen

Notice bibliographique

RevueLimnology and Oceanography · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine Bivalve and Aquaculture Studies
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesDanmarks Frie ForskningsfondDanmarks GrundforskningsfondVillum Fonden
Mots-clésPelagic zoneCopepodEnvironmental scienceDenitrificationEcologyOceanographyBiologyFisheryCrustaceanChemistryGeologyNitrogen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Copepods are exposed to a high non‐predatory mortality and their decomposing carcasses act as microniches with intensified microbial activity. Sinking carcasses could thereby represent anoxic microenvironment sustaining anaerobic microbial pathways in otherwise oxic water columns. Using non‐invasive O 2 imaging, we document that carcasses of Calanus finmarchicus had an anoxic interior even at fully air‐saturated ambient O 2 level. The extent of anoxia gradually expanded with decreasing ambient O 2 levels. Concurrent microbial sampling showed the expression of nitrite reductase genes ( nirS ) in all investigated carcass samples and thereby documented the potential for microbial denitrification in carcasses. The nirS gene was occasionally expressed in live copepods, but not as consistently as in carcasses. Incubations of sinking carcasses in 15 amended seawater demonstrated denitrification, of which on average 34% ± 17% ( n = 28) was sustained by nitrification. However, the activity was highly variable and was strongly dependent on the ambient O 2 levels. While denitrification was present even at air‐saturation (302 μ mol L −1 ), the average carcass specific activity increased several orders of magnitude to ∼ 1 nmol d −1 at 20% air‐saturation (55 μ mol O 2 L −1 ) at an ambient temperature of 7°C. Sinking carcasses of C. finmarchicus therefore represent hotspots of pelagic denitrification, but the quantitative importance as a sink for bioavailable nitrogen is strongly dependent on the ambient O 2 level. The importance of carcass associated denitrification could be highly significant in O 2 depleted environments such as Oxygen Minimum Zones (OMZ).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,408
Score d'incertitude au seuil0,362

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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