Copepod carcasses as microbial hot spots for pelagic denitrification
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Copepods are exposed to a high non‐predatory mortality and their decomposing carcasses act as microniches with intensified microbial activity. Sinking carcasses could thereby represent anoxic microenvironment sustaining anaerobic microbial pathways in otherwise oxic water columns. Using non‐invasive O 2 imaging, we document that carcasses of Calanus finmarchicus had an anoxic interior even at fully air‐saturated ambient O 2 level. The extent of anoxia gradually expanded with decreasing ambient O 2 levels. Concurrent microbial sampling showed the expression of nitrite reductase genes ( nirS ) in all investigated carcass samples and thereby documented the potential for microbial denitrification in carcasses. The nirS gene was occasionally expressed in live copepods, but not as consistently as in carcasses. Incubations of sinking carcasses in 15 amended seawater demonstrated denitrification, of which on average 34% ± 17% ( n = 28) was sustained by nitrification. However, the activity was highly variable and was strongly dependent on the ambient O 2 levels. While denitrification was present even at air‐saturation (302 μ mol L −1 ), the average carcass specific activity increased several orders of magnitude to ∼ 1 nmol d −1 at 20% air‐saturation (55 μ mol O 2 L −1 ) at an ambient temperature of 7°C. Sinking carcasses of C. finmarchicus therefore represent hotspots of pelagic denitrification, but the quantitative importance as a sink for bioavailable nitrogen is strongly dependent on the ambient O 2 level. The importance of carcass associated denitrification could be highly significant in O 2 depleted environments such as Oxygen Minimum Zones (OMZ).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».