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Enregistrement W2113627743 · doi:10.1158/1055-9965.epi-06-0792

Reproducibility of Serum Sex Steroid Assays in Men by RIA and Mass Spectrometry

2007· article· en· W2113627743 sur OpenAlexafffund
Ann W. Hsing, Frank Z. Stanczyk, Alain Bélanger, Paul C. Schroeder, Lilly Chang, Roni T. Falk, Thomas R. Fears

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHormonal and reproductive studies
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthUniversité Laval
Mots-clésEstroneChemistryChromatographySteroidAndrosteroneAndrostenedioneDihydrotestosteroneTestosterone (patch)GlucuronideEtiocholanoloneMass spectrometryGas chromatography–mass spectrometryCoefficient of variationAndrogenEndocrinologyMetaboliteHormoneBiochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is an increasing trend to apply gas chromatography combined with mass spectrometry (GC-MS) or liquid chromatography tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) assay methods to large-scale epidemiologic studies for the measurement of serum sex steroids. These methods are generally considered the gold standard for sex steroid measurements because of their accuracy, sensitivity, turnaround time, and ability to assess a more complete panel of steroid metabolites in the same run. In this report, we evaluated the precision, including within-batch (intra) and between-batch (inter) reproducibility, of steroid hormone measurements determined by GC-MS and LC-MS/MS assays and RIA and compared measurements among these methods. Specifically, 282 overnight fasting serum samples from 20 male volunteers were analyzed for 12 steroid metabolites by GC-MS or LC-MS/MS in one lab over a 4-month period. Six of the analytes were also measured by RIA in another lab. Unconjugated hormones, including testosterone, dihydrotestosterone, dehydroepiandrosterone, androstenedione, androst-5-ene-3beta,17beta-diol, estrone, and estradiol, were measured by GC-MS, whereas conjugated hormones, including DHEA sulfate, androsterone glucuronide, 5alpha-androstane-3alpha,17beta-diol 3-glucuronide, 5alpha-androstane-3alpha,17beta-diol 17-glucuronide, and estrone sulfate, were measured by LC-MS/MS. A subset of these hormones, including testosterone, dihydrotestosterone, androstenedione, 5alpha-androstane-3alpha,17beta-diol 17-glucuronide, estrone, and estradiol, were also measured by RIA following extraction and chromatography. We used the coefficient of variation (CV) and the intraclass correlation coefficient (ICC) to assess within- and between-batch assay variations. For the 12 analytes measured by GC-MS or LC-MS/MS, CVs and ICCs for within- and between-batch measurements were similar, with CVs ranging from 6.1% to 21.4% and ICCs ranging from 87.6% to 99.2%. The six analytes measured by RIA had good CVs and ICCs, with CVs <10% and ICCs >70% (range, 71.7-99.7%). For the six metabolites that were measured by both methods, the CVs were similar, whereas the ICCs were generally higher with the GC-MS method. The absolute values for each analyte measured by RIA and GC-MS differed, with RIAs usually yielding markedly higher levels than GC-MS, although the Pearson and Spearman correlation coefficients for these six analytes were near one and all were significant (P < 0.001). Our results show that RIA, GC-MS, and LC-MS/MS assays for androgens and estrogens in the two labs included in the study have good reproducibility, as measured by small CVs (<15%) and high ICCs (>80%), with the exception of estradiol (71.7%) when measured by RIA. Despite substantial differences in absolute measurements of sex steroid hormones by RIA and MS methods, correlations between the two assays for the six sex steroids measured in the two labs were high (>0.9). However, it is important for future large epidemiologic studies to incorporate MS with high reproducibility and specificity to measure a more complete profile of androgen and estrogen metabolites to clarify the role of sex steroids in prostate cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,049
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,046
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,951
Score d'incertitude au seuil0,261

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0490,046
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,328 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
DomaineReproductibilité
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations189
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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