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Enregistrement W2113893605 · doi:10.1128/jcm.40.7.2357-2362.2002

Comparison of an Industry-Derived LCx <i>Chlamydia pneumoniae</i> PCR Research Kit to In-House Assays Performed in Five Laboratories

2002· article· en· W2113893605 sur OpenAlexaff
Max Chernesky, Marek Smieja, Julius Schachter, James T. Summersgill, Laura G. Schindler, Natalie Solomon, Karen Campbell, LeeAnn Campbell, Alison L. Cappuccio, Charlotte A. Gaydos, Sylvia Chong, Jeanne Moncada, Jack Phillips, Dan Jang, Astrid Petrich, Margaret R. Hammerschlag, Mike Cerney, James B. Mahony

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChlamydiaPolymerase chain reactionChlamydialesRoche DiagnosticsBiologyChlamydiaceaeReproducibilityVirologyMolecular biologyMedicineInternal medicineImmunologyChromatographyChemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In a multicenter comparison of PCR assays utilizing 120 quantitated samples of 16 Chlamydia pneumoniae isolates, an LCx research-use-only (RUO) PCR developed by Abbott Laboratories demonstrated 100% sensitivity on 48 samples with >1 copy of DNA per microl of specimen. The sensitivities of five in-house PCR assays ranged from 54 to 94% for the same samples. All six assays showed decreased sensitivities as the DNA copy numbers of the samples decreased. Overall, sensitivities ranged from 68% for the LCx PCR assay to 29% for one of the in-house tests. The LCx RUO PCR and three of the five in-house PCR tests reported no false positives with the 24 negative samples. Increasing the number of replicates tested increased the sensitivities of all of the assays, including the LCx PCR. The LCx RUO assay showed high reproducibility for a single technologist and between technologists, with a kappa agreement of 0.77. The within-center agreements of the five in-house PCR tests varied from 0.19 to 0.74 on two challenges of 60 specimens 1 month apart. The LCx C. pneumoniae RUO PCR shows excellent potential for use in clinical studies, which could enable standardization of results in the field.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesIntégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,310
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0020,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,196
Tête enseignante GPT0,493
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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