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Enregistrement W2113937251 · doi:10.1074/jbc.m405195200

Enrichment of Endoplasmic Reticulum with Cholesterol Inhibits Sarcoplasmic-Endoplasmic Reticulum Calcium ATPase-2b Activity in Parallel with Increased Order of Membrane Lipids

2004· article· en· W2113937251 sur OpenAlexaff
Yankun Li, Mingtao Ge, Laura Ciani, George Kuriakose, Emily J. Westover, Miroslav Důra, Douglas F. Covey, Jack H. Freed, Frederick R. Maxfield, Jonathan Lytton, Ira Tabas

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésEndoplasmic reticulumUnfolded protein responseCell biologyCalciumChemistryCholesterolCalcium pumpCalcium ATPaseBiochemistrySTIM1ATPaseBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Macrophages in advanced atherosclerotic lesions accumulate large amounts of unesterified, or "free," cholesterol (FC). FC accumulation induces macrophage apoptosis, which likely contributes to plaque destabilization. Apoptosis is triggered by the enrichment of the endoplasmic reticulum (ER) with FC, resulting in depletion of ER calcium stores, and induction of the unfolded protein response. To explain the mechanism of ER calcium depletion, we hypothesized that FC enrichment of the normally cholesterol-poor ER membrane inhibits the macrophage ER calcium pump, sarcoplasmic-endoplasmic reticulum calcium ATPase-2b (SERCA2b). FC enrichment of ER membranes to a level similar to that occurring in vivo inhibited both the ATPase activity and calcium sequestration function of SERCA2b. Enrichment of ER with ent-cholesterol or 14:0-18:0 phosphatidylcholine, which possess the membrane-ordering properties of cholesterol, also inhibited SERCA2b. Moreover, at various levels of FC enrichment of ER membranes, there was a very close correlation between increasing membrane lipid order, as monitored by 16-doxyl-phosphatidycholine electron spin resonance, and SERCA2b inhibition. In view of these data, we speculate that SERCA2b, a conformationally active protein with 11 membrane-spanning regions, loses function due to decreased conformational freedom in FC-ordered membranes. This biophysical model may underlie the critical connection between excess cholesterol, unfolded protein response induction, macrophage death, and plaque destabilization in advanced atherosclerosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations278
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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