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Enregistrement W2113954965 · doi:10.4049/jimmunol.176.12.7511

Molecular and Genetic Basis for Strain-Dependent NK1.1 Alloreactivity of Mouse NK Cells

2006· article· en· W2113954965 sur OpenAlexafffund
James R. Carlyle, Aruz Mesci, Belma Ljutic, Simon Bélanger, Lee‐Hwa Tai, Etienne Rousselle, Angela D. Troke, Marie-France Proteau, Andrew P. Makrigiannis

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensMontreal Clinical Research InstituteSunnybrook HospitalWomen's College HospitalUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Toronto
Mots-clésEpitopeBiologyGeneMolecular biologyAllelePhenotypeAntibodyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

NK1.1 alloantigen expression can be used to define NK cells in certain mouse strains, such as B6 (NKR-P1C) and SJL (NKR-P1B). However, BALB/c NK cells do not react with the anti-NK1.1 mAb, PK136. To investigate the NK1.1(-) phenotype of BALB/c NK cells, we have undertaken NK1.1 epitope mapping and genomic analysis of the BALB/c Nkrp1 region. Bacterial artificial chromosome library analysis reveals that, unlike the Ly49 region, the Nkrp1-Ocil/Clr region displays limited genetic divergence between B6 and BALB/c mice. In fact, significant divergence is confined to the Nkrp1b and Nkrp1c genes. Strikingly, the B6 Nkrp1d gene appears to represent a divergent allele of the Nkrp1b gene in BALB/c mice and other strains. Importantly, BALB/c NK cells express abundant and functional Nkrp1 transcripts, and the BALB/c NKR-P1B receptor functionally binds Ocil/Clr-b ligand. However, the BALB/c NKR-P1B/C sequences differ from those of the known NK1.1 alloantigens, and epitope mapping demonstrates that directed mutation of a single amino acid in the NKR-P1B(BALB) protein confers NK1.1 reactivity. Thus, PK136 mAb recognizes, in part, a distal C-terminal epitope present in NKR-P1B(Sw/SJL) and NKR-P1C(B6), but absent in NKR-P1A/D/F(B6) and NKR-P1B/C(BALB). Allelic divergence of the Nkrp1b/c gene products and limited divergence of the BALB/c Nkrp1-Ocil/Clr region explain a longstanding confusion regarding the strain-specific NK1.1 alloantigen reactivity of mouse NK cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,366

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations134
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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