Isolation of a human betaretrovirus resembling mouse mammary tumor virus (MMTV) from patients with primary biliary cirrhosis
Notice bibliographique
Résumé
A human betaretrovirus resembling the MMTV has been cloned from biliary epithelial cells and perihepatic lymph nodes of patients with primary biliary cirrhosis (PBC) [ 1 ]. The human betaretrovirus can trigger a PBC specific phenotype in vitro and antiviral therapy improves both biochemical and histological disease in patients with PBC. The human betaretrovirus can be detected in perihepatic lymph nodes in 75% of PBC patients by immunochemistry and RT-PCR [ 1 ]. Our goal was to provide proof that a human betaretrovirus infects patients by isolating the human betaretrovirus and detecting viral integration sites. DNA from livers, biliary epithelium and lymph nodes was used to identify proviral integration sites using linker mediated PCR. PBC peri-hepatic lymph node homogenates were co-cultured with Hs578T cells and infected cells were subcloned, clonally expanded and tested for betaretrovirus infection. Betaretrovirus was detected by RT-PCR in 16 supernatants from 28 subcloned Hs578T co-cultured cells. Betaretrovirus particles were identified by electron microscopy and 17 Integration sites were identified in infected Hs578T cells. 47 integration sites were identified from patients' samples. In patients with PBC, 1 or 2 integration sites were detected in 4 of 5 PBC biliary epithelial samples, 1 of 3 liver samples and 1 to 14 integration sites (median 5) were found in 7 of 10 PBC lymph nodes. Of note, the human betaretrovirus preferentially integrated within genes in 61% samples. Clustering of 3 or more sites within 15,000 Kb was observed on chromosomes 4, 5, 6, 8 and 11. The unequivocal detection of viral integration sites in the human genome and viral isolation studies provide proof that patients with PBC have infection with a transmissible betaretrovirus. Most PBC patients have evidence of betaretrovirus infection in biliary epithelial cells targeted by the disease process, whereas the perihepatic lymph nodes have the highest viral burden.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».