Bacterial diversity in Fe‐rich hydrothermal sediments at two South Tonga Arc submarine volcanoes
Notice bibliographique
Résumé
Seafloor iron oxide deposits are a common feature of submarine hydrothermal systems. Morphological study of these deposits has led investigators to suggest a microbiological role in their formation, through the oxidation of reduced Fe in hydrothermal fluids. Fe-oxidizing bacteria, including the recently described Zetaproteobacteria, have been isolated from a few of these deposits but generally little is known about the microbial diversity associated with this habitat. In this study, we characterized bacterial diversity in two Fe oxide samples collected on the seafloor of Volcanoes 1 and 19 on the South Tonga Arc. We were particularly interested in confirming the presence of Zetaproteobacteria at these two sites and in documenting the diversity of groups other than Fe oxidizers. Our results (small subunit rRNA gene sequence data) showed a surprisingly high bacterial diversity, with 150 operational taxonomic units belonging to 19 distinct taxonomic groups. Both samples were dominated by Zetaproteobacteria Fe oxidizers. This group was most abundant at Volcano 1, where sediments were richer in Fe and contained more crystalline forms of Fe oxides. Other groups of bacteria found at these two sites include known S- and a few N-metabolizing bacteria, all ubiquitous in marine environments. The low similarity of our clones with the GenBank database suggests that new species and perhaps new families were recovered. The results of this study suggest that Fe-rich hydrothermal sediments, while dominated by Fe oxidizers, can be exploited by a variety of autotrophic and heterotrophic micro-organisms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».