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Enregistrement W2114124993 · doi:10.1186/1475-2875-11-193

PCR detection of malaria parasites in desiccated Anopheles mosquitoes is uninhibited by storage time and temperature

2012· article· en· W2114124993 sur OpenAlexfundno aff
Mark A. Rider, Brian D. Byrd, Joseph Keating, Dawn M. Wesson, Kevin A. Caillouët

Notice bibliographique

RevueMalaria Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesU.S. Public Health ServiceCenters for Disease Control and PreventionSchool of Medicine, New York UniversityYork UniversityTulane University
Mots-clésAnopheles stephensiBiologyMalariaAnophelesParasite hostingPolymerase chain reactionPlasmodium (life cycle)Cold storageDNA extractionParasitologyVirologyVeterinary medicineBotanyLarvaZoologyAedes aegyptiImmunologyMedicineHorticultureGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Reliable methods to preserve mosquito vectors for malaria studies are necessary for detecting Plasmodium parasites. In field settings, however, maintaining a cold chain of storage from the time of collection until laboratory processing, or accessing other reliable means of sample preservation is often logistically impractical or cost prohibitive. As the Plasmodium infection rate of Anopheles mosquitoes is a central component of the entomological inoculation rate and other indicators of transmission intensity, storage conditions that affect pathogen detection may bias malaria surveillance indicators. This study investigated the effect of storage time and temperature on the ability to detect Plasmodium parasites in desiccated Anopheles mosquitoes by real-time polymerase chain reaction (PCR). METHODS: Laboratory-infected Anopheles stephensi mosquitoes were chloroform-killed and stored over desiccant for 0, 1, 3, and 6 months while being held at four different temperatures: 28, 37, -20 and -80°C. The detection of Plasmodium DNA was evaluated by real-time PCR amplification of a 111 base pair region of block 4 of the merozoite surface protein. RESULTS: Varying the storage time and temperature of desiccated mosquitoes did not impact the sensitivity of parasite detection. A two-way factorial analysis of variance suggested that storage time and temperature were not associated with a loss in the ability to detect parasites. Storage of samples at 28°C resulted in a significant increase in the ability to detect parasite DNA, though no other positive associations were observed between the experimental storage treatments and PCR amplification. CONCLUSIONS: Cold chain maintenance of desiccated mosquito samples is not necessary for real-time PCR detection of parasite DNA. Though field-collected mosquitoes may be subjected to variable conditions prior to molecular processing, the storage of samples over an inexpensive and logistically accessible desiccant will likely ensure accurate assessment of malaria parasite presence without diminishing PCR-detection of parasites in mosquitoes stored for at least six months.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,684
Score d'incertitude au seuil0,900

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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