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Enregistrement W2114128472 · doi:10.1016/s0378-1097(03)00725-0

Stereoselective biosynthesis of chloroarylpropane diols by the basidiomycete<i>Bjerkandera adusta</i>: exploring the roles of amino acids, pyruvate, glycerol and phenyl acetyl carbinol

2003· article· en· W2114128472 sur OpenAlexaff
Peter J. Silk, John B. Macaulay

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Letters · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAnalytical Chemistry and Chromatography
Établissements canadiensResearch and Productivity CouncilNatural Resources CanadaCanadian Forest Service
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryGlycerolBiosynthesisDiolStereochemistryPhenylalanineAmino acidOrganic chemistryBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bjerkandera adusta produces many chlorometabolites including chlorinated anisyl metabolites (CAMs) and 1-arylpropane-1,2-diols (1, 2, 3, 4) as idiophasic metabolic products of L-phenylalanine. These diols are stereoselectively biosynthesized from a C7-unit (benzylic, from L-phenylalanine) and a C2-unit, of unknown origin, as predominantly erythro (1R,2S) enantiomers. Of the labeled amino acids tested as possible C2-units, at the 4-10 mM level, none were found to efficiently label the 2,3-propane carbons of the diols. However, glycine (2-13C), L-serine (2,3,3-d3) and L-methionine (methyl-d3) entered the biomethylation pathway. Neither pyruvate (2,3-13C2), acetate (1,2-13C2), acetaldehyde (d4) nor ethanol (ethyl-d5) labeled the 2,3-propane carbons of the diols at the 4-10 mM level. Pyruvate (2,3-13C2) and L-serine (2,3,3-d3) (which also entered the biomethylation pathway) did, however, effectively label the 2,3-propane carbons of the alpha-ketols and diols at the 40 mM level as evidenced by mass spectrometry. Glycerol (1,1,2,3,3-d5) also appeared to label one of the 2,3-propane carbons (ca. 5% as 2H2 in the C3 side chain) as suggested by mass spectrometric data and also entered the biomethylation pathway, likely via amino acid synthesis. Glycerol (through pyruvate), therefore, likely supplies C2 and C3 of the propane side chain with arylpropane diol biosynthesis. Incubation of B. adusta with synthetic [2-2H1, 2-18O]-glycerol showed that neither 2H nor 18O were incorporated in the alpha-ketols or diols. The oxygen atom on the C2 of the ketols/diols, therefore, does not appear to come from the oxygen atom on the C2 of glycerol. Glycerol, however, can readily form L-serine (which can then form pyruvate via PLP/serine dehydratase and involve transamination washing out the 18O label and providing the oxygen from water), and can then go on to label the C2-unit. Labeled alpha-ketol, phenyl acetyl carbinol (5) (PAC; ring-d(5), 2,3-13C2 propane) cultured with B. adusta leads to stereospecific reduction to the (1R,2S)-diol (6) (ring-d5 and 2,3-13C2); in all other metabolites produced, the 2,3-13C2) label is washed out. Incubation of the fungus with 4-fluorobenzaldehyde (13) produces a pooling of predominantly erythro (1R,2S) 1-(4'-fluorophenyl)-1,2-propane diol (18 as diacetate) (through the corresponding alpha-ketols 16, 17). Blocking the para-position with fluorine thus appears to prevent ring oxygenation and also chlorination, forcing the conclusion that para-ring oxygenation precedes meta-chlorination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,907

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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