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Enregistrement W2114145258 · doi:10.1210/mend.14.9.0518

Cytochrome P450RAI(CYP26) Promoter: A Distinct Composite Retinoic Acid Response Element Underlies the Complex Regulation of Retinoic Acid Metabolism

2000· article· en· W2114145258 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMolecular Endocrinology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinoids in leukemia and cellular processes
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyRetinoic acidMolecular biologyRetinoic acid receptorRetinoid X receptorResponse elementLuciferasePromoterTransfectionGeneBiochemistryTranscription factorNuclear receptorGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The catabolism of retinoic acid (RA) is an essential mechanism for restricting the exposure of specific tissues and cells to RA. We recently reported the identification of a RA-inducible cytochrome P450 [P450RAI(CYP26)], in zebrafish, mouse, and human, which was shown to be responsible for RA catabolism. P450RAI exhibits a complex spatiotemporal pattern of expression during development and is highly inducible by exogenous RA treatment in certain tissues and cell lines. Sequence analysis of the proximal upstream region of the P450RAI promoter revealed a high degree of conservation between zebrafish, mouse, and human. This region of the promoter contains a canonical retinoic acid response element (5'-AGT-TCA-(n)5-AGTTCA-3'), embedded within a 32-bp region (designated R1), which is conserved among all three species. Electrophoretic mobility shift assays using this element demonstrated the specific binding of murine retinoic acid receptor-gamma (RARgamma) and retinoid X receptor-alpha (RXRalpha) proteins. Transient transfection experiments with the mouse P450RAI promoter fused to a luciferase reporter gene showed transcriptional activation in the presence of RA in HeLa, Cos-1, and F9 wild-type cells. This activation, as well as basal promoter activity, was abolished upon mutation of the RARE. Deletion and mutational analyses of the P450RAI promoter, as well as DNase I footprinting studies, revealed potential binding sites for several other proteins in conserved regions of the promoter. Also, two conserved 5'-TAAT-3' sequences flanking the RARE were investigated for their potential importance in P450RAI promoter activity. Moreover, these studies revealed an essential requirement for a G-rich element (designated GGRE), located just upstream of the RARE, for RA inducibility. This element was demonstrated to form complexes with Sp1 and Sp3 using nuclear extracts from either murine F9 or P19 cells. Together, these results indicate that the P450RAI-RARE is atypical in that conserved flanking sequences may play a very important role in regulating RA inducibility and expression of P450RAI(CYP26).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle