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Enregistrement W2114151069 · doi:10.1128/jcm.41.1.237-241.2003

Detection and Differentiation of <i>Entamoeba histolytica</i> and <i>Entamoeba dispar</i> Isolates in Clinical Samples by PCR and Enzyme-Linked Immunosorbent Assay

2003· article· en· W2114151069 sur OpenAlexaff
Patrick Gonin, Louise Trudel

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmoebic Infections and Treatments
Établissements canadiensInstitut National de Santé Publique du Québec
Organismes subventionnairesLondon School of Hygiene and Tropical Medicine
Mots-clésDisparEntamoeba histolyticaBiologyContext (archaeology)MicrobiologyPolymerase chain reactionEntamoebaVirologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Differential diagnosis of Entamoeba histolytica (pathogenic) and Entamoeba dispar (nonpathogenic), which are two morphologically identical species of amebae, is essential both for treatment decision and public health knowledge. The study reported here was designed to choose a reference differentiation technique. Stool samples (n = 95) were tested by microscopy, TechLab enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs), and an in-house PCR. The target for the PCR amplification was a small region (135 bp) of the SSU rRNA selected to increase the sensitivity of the test. Sixty-eight specimens tested positive by PCR: 2 for E. histolytica and 66 for E. dispar. For detection of E. dispar, ELISA performance was lower than that of microscopy in this reference context, while PCR was much more sensitive than microscopy. Given the low proportion of E. histolytica cases, test performance for this species is difficult to assess. However, for differentiation, PCR performed well on simulated samples, while ELISA gave a discordant result for one of the two samples PCR positive for E. histolytica during the study. This report also confirms that E. dispar infection is significantly higher among travelers and underlines the possibility of acquiring E. histolytica infection in regions that are not areas of endemicity. Because of its lower sensitivity, the interest of ELISA for Entamoeba detection and differentiation in stools seems questionable in nontropical regions. On the other hand, results suggest that PCR should be useful as a reference test for sensitive differentiation of both species and to contribute to physicians' decision in treatment of E. histolytica- or E. dispar-infected patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations146
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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