Mutations in Plasmodium falciparum K13 propeller gene from Bangladesh (2009–2013)
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Bangladesh is a malaria hypo-endemic country sharing borders with India and Myanmar. Artemisinin combination therapy (ACT) remains successful in Bangladesh. An increase of artemisinin-resistant malaria parasites on the Thai-Cambodia and Thai-Myanmar borders is worrisome. K13 propeller gene (PF3D7_1343700 or PF13_0238) mutations have been linked to both in vitro artemisinin resistance and in vivo slow parasite clearance rates. This group undertook to evaluate if mutations seen in Cambodia have emerged in Bangladesh where ACT use is now standard for a decade. METHODS: Samples were obtained from Plasmodium falciparum-infected malaria patients from Upazila health complexes (UHC) between 2009 and 2013 in seven endemic districts of Bangladesh. These districts included Khagrachari (Matiranga UHC), Rangamati (Rajasthali UHC), Cox's Bazar (Ramu and Ukhia UHC), Bandarban (Lama UHC), Mymensingh (Haluaghat UHC), Netrokona (Durgapur and Kalmakanda UHC), and Moulvibazar (Sreemangal and Kamalganj UHC). RESULTS: Out of 296 microscopically positive P. falciparum samples, 271 (91.6%) were confirmed as mono-infections by both real-time PCR and nested PCR. The K13 propeller gene from 253 (93.4%) samples was sequenced bi-directionally. One non-synonymous mutation (A578S) was found in Bangladeshi clinical isolates. The A578S mutation was confirmed and lies adjacent to the C580Y mutation, the major mutation causing delayed parasite clearance in Cambodia. Based on computational modeling A578S should have a significant effect on tertiary structure of the protein. CONCLUSION: The data suggest that P. falciparum in Bangladesh remains free of the C580Y mutation linked to delayed parasite clearance. However, the mutation A578S is present and based on structural analysis could affect K13 gene function. Further in vivo clinical studies are required to validate the effect of this mutation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle