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Enregistrement W2114355077 · doi:10.1093/hmg/10.23.2627

Dystrophin muscle enhancer 1 is implicated in the activation of non-muscle isoforms in the skeletal muscle of patients with X-linked dilated cardiomyopathy

2001· article· en· W2114355077 sur OpenAlexaff
Carlo Bastianutto

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesBritish Heart FoundationMuscular Dystrophy Association
Mots-clésSkeletal muscleBiologyDystrophinITGA7Gene isoformEnhancerDuchenne muscular dystrophyMyocytePromoterCardiac muscleMuscular dystrophyUtrophinMolecular biologyEndocrinologyInternal medicineGene expressionGeneGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

X-linked dilated cardiomyopathy (XLDC) is a dystrophinopathy characterized by severe cardiomyopathy with no skeletal muscle involvement. Several XLDC patients have been described with mutations that abolish dystrophin muscle (M) isoform expression. The absence of skeletal muscle degeneration normally associated with loss of dystrophin function was shown to be due to increased expression of brain (B) and cerebellar Purkinje (CP) isoforms of the gene exclusively in the skeletal muscle of these patients. This suggested that the B and CP promoters have an inherent capacity to function in skeletal muscle or that they are up-regulated by a skeletal muscle-specific enhancer unaffected by the mutations in these patients. In this work we have analyzed the deletion breakpoints of two XLDC patients with deletions removing the M promoter and exon 1, but not affecting the B and CP promoters. Despite the presence of several muscle-specific regulatory motifs, the B and CP promoters were found to be essentially inactive in muscle cell lines and primary cultures. As dystrophin muscle enhancer 1 (DME1), the only known muscle-specific enhancer within the dystrophin gene, is preserved in these patients, we tested its ability to up-regulate the B and CP promoters in muscle cells. B and CP promoter activity was significantly increased in the presence of DME1, and more importantly, activation was observed exclusively in cells presenting a skeletal muscle phenotype. These results point to a role for DME1 in the induction of B and CP isoform expression in the skeletal muscle of XLDC patients defective for M isoform expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,939
Score d'incertitude au seuil0,542

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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