Effect of viral infection on sinking rates of Heterosigma akashiwo and its implications for bloom termination
Notice bibliographique
Résumé
Viruses play many important roles in the ecology of marine microbes, including that of mortality agents of phytoplankton.The widespread abundance of viruses in sediments, coupled with observations that some flagellated algae lose motility when infected, prompted this investigation into the fate of infected cells and the propagation of infection throughout a population in situ.We used 2 unrelated viruses that infect the bloom-forming alga Heterosigma akashiwo as model systems.Settling columns were used to determine the impact of viral infection on the vertical movement of H. akashiwo.Within 24 h following infection with HaRNAV 263 or H. akashiwo virus strain OIs1, 20.9 ± 5.8 and 12.2 ± 1.9% of the populations were sinking at rates of 1.25 and 0.73 m d -1 , respectively.By 48 h post-infection approximately 50% of cells infected with either virus had lysed.As sinking cells would encounter decreasing levels of light in the natural environment, we incubated infected cultures in complete darkness and compared the length of the lytic cycle to that of cultures incubated under a L:D cycle.Again, approximately 50% of the population lysed by 48 h, regardless of the light conditions or type of virus, and lysis of the entire population was complete by 144 h.Based on these results, we propose that, depending on the characteristics of the water column, there are 3 potential fates for viruses from cells infected in situ.In water with a deep mixed layer (> 8 m), lysis of infected cells would occur within the mixed layer and the infection would be propagated within the euphotic zone.If the water is relatively deep (100s of meters), and the mixed layer shallow (< 8 m), cell lysis and viral release would occur below the mixed layer, where viral propagation would not occur.Finally, in shallow waters (10s of meters) lysis of infected cells would occur at the sediment surface, resulting in the accumulation of a high abundance of viruses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».