Identification of novel murine parvovirus strains by epidemiological analysis of naturally infected mice
Notice bibliographique
Résumé
Random-source DNA samples obtained from naturally infected laboratory mice (n=381) were evaluated by PCR and RFLP analysis to determine the prevalence of murine parvovirus strains circulating in contemporary laboratory mouse colonies. Mouse parvovirus (MPV) was detected in 77% of samples, Minute virus of mice (MVM) was detected in 16% of samples and both MVM and MPV were detected in 7% of samples. MVMm, a strain recently isolated from clinically ill NOD-mu chain knockout mice, was detected in 91% of MVM-positive samples, with the Cutter strain of MVM (MVMc) detected in the remaining samples. The prototypic and immunosuppressive strains of MVM were not detected in any of the samples. MPV-1 was detected in 78% of the MPV-positive samples and two newly identified murine parvoviruses, tentatively named MPV-2 and MPV-3, were detected in 21 and 1% of the samples, respectively. The DNA sequence encompassing coding regions of the viral genome and the predicted protein sequences for MVMm, MPV-2 and MPV-3 were determined and compared with those of other rodent parvovirus strains and LuIII parvovirus. The genomic organization for the newly identified viral strains was similar to that of other rodent parvoviruses, and nucleotide sequence identities indicated that MVMm was most similar to MVMc (96.1%), MPV-3 was most similar to hamster parvovirus (HaPV) (98.1%) and MPV-2 was most similar to MPV-1 (95.3%). The genetic similarity of MPV-3 and HaPV suggests that HaPV epizootics in hamsters may result from cross-species transmission, with mice as the natural rodent host for this virus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».