A consensus CaMK IV-responsive RNA sequence mediates regulation of alternative exons in neurons
Notice bibliographique
Résumé
Neurons make extensive use of alternative pre-mRNA splicing to regulate gene expression and diversify physiological responses. We showed previously in a pituitary cell line that the Ca(++)/calmodulin-dependent protein kinase CaMK IV specifically repressed splicing of the BK channel STREX exon. This repression is dependent on a CaMK IV-responsive RNA element (CaRRE) within the STREX 3' splice site. Here, we report that similar Ca(++) regulation of splicing, mediated by L-type calcium channels and CaM kinase IV, occurs in cultured neurons and in the brain. We identify a critical CaRRE motif (CACATNRTTAT) that is essential for conferring CaMK IV repression on an otherwise constitutive exon. Additional Ca(++)-regulated exons that carry this consensus sequence are also identified in the human genome. Thus, the Ca(++)/CaMK IV pathway in neurons controls the alternative splicing of a group of exons through this short CaRRE consensus sequence. The functions of some of these exons imply that splicing control through the CaMK IV pathway will alter neuronal activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».