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Enregistrement W2114512817 · doi:10.1128/mcb.22.1.148-160.2002

SRm160 Splicing Coactivator Promotes Transcript 3′-End Cleavage

2002· article· en· W2114512817 sur OpenAlexafffund
Susan McCracken, Mark H. L. Lambermon, Benjamin J. Blencowe

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchMedical Research Council CanadaU.S. Department of Defense
Mots-clésRNA splicingBiologyPolyadenylationCleavage and polyadenylation specificity factorPrecursor mRNACleavage stimulation factorSR proteinCleavage factorCell biologyProtein splicingAlternative splicingCoactivatorMessenger RNAExonCleavage (geology)Molecular biologyGeneticsRNAGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Individual steps in the processing of pre-mRNA, including 5'-end cap formation, splicing, and 3'-end processing (cleavage and polyadenylation) are highly integrated and can influence one another. In addition, prior splicing can influence downstream steps in gene expression, including export of mRNA from the nucleus. However, the factors and mechanisms coordinating these steps in the maturation of pre-mRNA transcripts are not well understood. In the present study we demonstrate that SRm160 (for serine/arginine repeat-related nuclear matrix protein of 160 kDa), a coactivator of constitutive and exon enhancer-dependent splicing, participates in 3'-end formation. Increased levels of SRm160 promoted the 3'-end cleavage of transcripts both in vivo and in vitro. Remarkably, at high levels in vivo SRm160 activated the 3'-end cleavage and cytoplasmic accumulation of unspliced pre-mRNAs, thereby uncoupling the requirement for splicing to promote the 3'-end formation and nuclear release of these transcripts. Consistent with a role in 3'-end formation coupled to splicing, SRm160 was found to associate specifically with the cleavage polyadenylation specificity factor and to stimulate the 3'-end cleavage of splicing-active pre-mRNAs more efficiently than that of splicing-inactive pre-mRNAs in vitro. The results provide evidence for a role for SRm160 in mRNA 3'-end formation and suggest that the level of this splicing coactivator is important for the proper coordination of pre-mRNA processing events.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,882

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations103
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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