Structural Insights into Ca2+-dependent Regulation of Inositol 1,4,5-Trisphosphate Receptors by CaBP1
Notice bibliographique
Résumé
Calcium-binding protein 1 (CaBP1), a neuron-specific member of the calmodulin (CaM) superfamily, modulates Ca2+-dependent activity of inositol 1,4,5-trisphosphate receptors (InsP3Rs). Here we present NMR structures of CaBP1 in both Mg2+-bound and Ca2+-bound states and their structural interaction with InsP3Rs. CaBP1 contains four EF-hands in two separate domains. The N-domain consists of EF1 and EF2 in a closed conformation with Mg2+ bound at EF1. The C-domain binds Ca2+ at EF3 and EF4, and exhibits a Ca2+-induced closed to open transition like that of CaM. The Ca2+-bound C-domain contains exposed hydrophobic residues (Leu132, His134, Ile141, Ile144, and Val148) that may account for selective binding to InsP3Rs. Isothermal titration calorimetry analysis reveals a Ca2+-induced binding of the CaBP1 C-domain to the N-terminal region of InsP3R (residues 1-587), whereas CaM and the CaBP1 N-domain did not show appreciable binding. CaBP1 binding to InsP3Rs requires both the suppressor and ligand-binding core domains, but has no effect on InsP3 binding to the receptor. We propose that CaBP1 may regulate Ca2+-dependent activity of InsP3Rs by promoting structural contacts between the suppressor and core domains.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».