Reevaluation of a genetic model for the development of exostosis in hereditary multiple exostosis
Notice bibliographique
Résumé
EXT1 and EXT2 are genes that have been shown to cause hereditary multiple exostosis (HME), a syndrome marked by the formation of bony growths juxtaposed to the growth plate. These genes are members of a growing family of proteins with glycosyltransferase activity required for the synthesis of heparan sulfate chains. This protein activity is predicted to play a role in the expression of proteoglycans on the cell surface and in the extracellular matrix. We and others have previously suggested that a two-hit mutational model applies to the development of an exostosis where a germline mutation coupled with a somatic mutation results in the loss of EXT1 or EXT2 function and subsequent tumor formation. We report the direct sequencing and loss of heterozygosity (LOH) analysis of 12 exostoses from 10 HME families, 4 solitary exostoses, and their corresponding constitutional DNA. Of the 16 exostoses screened, we find only one solitary case in which two somatic mutations, a deletion and an LOH, are present. This provides limited support for the two-hit hypothesis involving the EXT1 and EXT2 genes for the development of an exostosis. Alternative models are developed based on the functional significance of EXT proteins in heparan sulfate biosynthesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».