Identification of Differentially Expressed Proteins in the Cervical Mucosa of HIV-1-Resistant Sex Workers
Notice bibliographique
Résumé
Novel tools are necessary to understand mechanisms of altered susceptibility to HIV-1 infection in women of the Pumwani Sex Worker cohort, Kenya. In this cohort, more than 140 of the 2000 participants have been characterized to be relatively resistant to HIV-1 infection. Given that sexual transmission of HIV-1 occurs through mucosal surfaces such as that in the cervicovaginal environment, our hypothesis is that innate immune factors in the genital tract may play a role in HIV-1 infection resistance. Understanding this mechanism may help develop microbicides and/or vaccines against HIV-1. A quantitative proteomics technique (2D-DIGE: two-dimensional difference in-gel electrophoresis) was used to examine cervical mucosa of HIV-1 resistant women ( n = 10) for biomarkers of HIV-1 resistance. Over 15 proteins were found to be differentially expressed between HIV-1-resistant women and control groups ( n = 29), some which show a greater than 8-fold change. HIV-1-resistant women overexpressed several antiproteases, including those from the serpin B family, and also cystatin A, a known anti-HIV-1 factor. Immunoblotting for a selection of the identified proteins confirmed the DIGE volume differences. Validation of these results on a larger sample of individuals will provide further evidence these biomarkers are associated with HIV-1 resistance and could help aid in the development of effective microbicides against HIV-1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».