Zinc Finger Proteins Designed To Specifically Target Duck Hepatitis B Virus Covalently Closed Circular DNA Inhibit Viral Transcription in Tissue Culture
Notice bibliographique
Résumé
Duck hepatitis B virus (DHBV) is a model virus for human hepatitis B virus (HBV), which infects approximately 360 million individuals worldwide. Nucleoside analogs can decrease virus production by inhibiting the viral polymerase; however, complete clearance by these drugs is not common because of the persistence of the HBV episome. HBV DNA is present in the nucleus as a covalently closed circular (cccDNA) form, where it drives viral transcription and progeny virus production. cccDNA is not the direct target of antiviral nucleoside analogs and is the source of HBV reemergence when antiviral therapy is stopped. To target cccDNA, six different zinc finger proteins (ZFP) were designed to bind DNA sequences in the DHBV enhancer region. After the binding kinetics were assessed by using electrophoretic mobility shift assays and surface plasmon resonance, two candidates with dissociation constants of 12.3 and 40.2 nM were focused on for further study. The ZFPs were cloned into a eukaryotic expression vector and cotransfected into longhorn male hepatoma cells with the plasmid pDHBV1.3, which replicates the DHBV life cycle. In the presence of each ZFP, viral RNA was significantly reduced, and protein levels were dramatically decreased. As a result, intracellular viral particle production was also significantly decreased. In summary, designed ZFPs are able to bind to the DHBV enhancer and interfere with viral transcription, resulting in decreased production of viral products and progeny virus genomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».