Tombusvirus recruitment of host translational machinery via the 3′ UTR
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Notice bibliographique
Résumé
RNA viruses recruit the host translational machinery by different mechanisms that depend partly on the structure of their genomes. In this regard, the plus-strand RNA genomes of several different pathogenic plant viruses do not contain traditional translation-stimulating elements, i.e., a 5'-cap structure and a 3'-poly(A) tail, and instead rely on a 3'-cap-independent translational enhancer (3'CITE) located in their 3' untranslated regions (UTRs) for efficient synthesis of viral proteins. We investigated the structure and function of the I-shaped class of 3'CITE in tombusviruses--also present in aureusviruses and carmoviruses--using biochemical and molecular approaches and we determined that it adopts a complex higher-order RNA structure that facilitates translation by binding simultaneously to both eukaryotic initiation factor (eIF) 4F and the 5' UTR of the viral genome. The specificity of 3'CITE binding to eIF4F is mediated, at least in part, through a direct interaction with its eIF4E subunit, whereas its association with the viral 5' UTR relies on complementary RNA-RNA base-pairing. We show for the first time that this tripartite 5' UTR/3'CITE/eIF4F complex forms in vitro in a translationally relevant environment and is required for recruitment of ribosomes to the 5' end of the viral RNA genome by a mechanism that shares some fundamental features with cap-dependent translation. Notably, our results demonstrate that the 3'CITE facilitates the initiation step of translation and validate a molecular model that has been proposed to explain how several different classes of 3'CITE function. Moreover, the virus-host interplay defined in this study provides insights into natural host resistance mechanisms that have been linked to 3'CITE activity.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle