MICROSATELLITE MARKER DEVELOPMENT AND GENETIC VARIATION IN THE TOXIC MARINE DIATOM <i>PSEUDO‐NITZSCHIA MULTISERIES</i> (BACILLARIOPHYCEAE)<sup>1</sup>
Notice bibliographique
Résumé
The genetic structure of phytoplankton populations is largely unknown. In this study we developed nine polymorphic microsatellite markers for the domoic acid–producing marine diatom Pseudo‐nitzschia multiseries (Hasle) Hasle. We then used them in the genotyping of 25 physiologically diverse field isolates and six of their descendants: 22 field isolates originated from eastern Canadian waters, two from European waters, and one from Russian waters. The numbers of alleles per locus ranged from three to seven and the observed heterozygosities from 0.39 to 0.70. A substantial degree of genetic variation was observed within the field isolates, with 23 different genotypes detected. The Russian isolate was the most genetically distinct, although there was also evidence of genetic differentiation at a more local scale. Mating experiments demonstrated that alleles were inherited in a Mendelian manner. Pseudo‐nitzschia multiseries primer pairs were tested on DNA from four congeners: P. calliantha Lundholm, Moestrup et Hasle; P. fraudulenta (P. T. Cleve) Hasle; P. pungens (Grunow ex P. T. Cleve) Hasle; and P. seriata (P. T. Cleve) H. Peragallo. Cross‐reactivity was only observed in P. pungens . Our results are a first step in understanding the genetic variation present at the Pseudo‐nitzschia “species” level and in determining the true biogeographic extent of Pseudo‐nitzschia species.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».