The development of preimplantation genetic diagnosis for myotonic dystrophy using multiplex fluorescent polymerase chain reaction and its clinical application
Notice bibliographique
Résumé
Preimplantation genetic diagnoses (PGD) for single gene defects require considerable time and resources for the standardization of polymerase chain reactions that are rapid, sensitive and reliable. Developing tests for the trinucleotide repeat diseases, where the expansion of unstable repeats produces the phenotypes, are particularly complex. One of these disorders is myotonic dystrophy where, at present, diagnosis at the single cell level relies on the detection of the normal alleles from both the affected and unaffected parent. The incorporation of short tandem repeat polymorphisms in the assay can give additional information to improve the accuracy of diagnosis. We have developed a multiplex fluorescent reaction for myotonic dystrophy and one of two closely mapped, highly heterozygous, short tandem repeats (D19S219 and D19S559) on chromosome 19 to reduce the possibility of misdiagnosis due to contamination, act as a control for allelic drop-out and maximize the number of embryos genotyped. This protocol was designed as a general diagnosis for myotonic dystrophy, using the most informative of the two polymorphisms for each couple. Subsequently this approach was used in a PGD treatment cycle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».