A high- and low-temperature inducible<i>Arabidopsis thaliana HSP101</i>promoter located in a nonautonomous<i>Mutator</i>-like element
Notice bibliographique
Résumé
Transcriptional activity of a 573-bp fragment of HSP101 (At1g74310) incorporated into a Mutator-like element (MULE) transposon was investigated in Arabidopsis thaliana Columbia. Sequence identity between the HSP101-MULE arrangement and a continuous segment of the original HSP101 promoter, 5' UTR exon, and open reading frame (ORF) was high (87%) but lower in the 5' UTR intron (69%). Collectively, the HSP101 ORF, the MULE 5' terminal inverted repeat (TIR), and the 1.3 kb immediately upstream of the TIR is located on chromosome IV, and we refer to it as HSP101B. Located within the HSP101B promoter, upstream of 2 heat shock elements (HSEs), are 4 COR15a-like low-temperature response elements (LTREs). The HSP101B ORF was transcribed in the leaves and influorescences of high-temperature stress (HTS) treated Arabidopsis thaliana but not in low-temperature stress (LTS) and control plants. Transiently transformed Arabidopsis seedlings, as well as stable transformed lines of Linum usitatissimum (flax) and Brassica napus (canola) containing a HSP101B promoter:GUS construct, showed either LTS-, or LTS- and HTS-, induced beta-glucuronidase expression. Results from PCR amplifications of HpaII- and MspI-digested Arabidopsis genomic DNA suggest that endogenous expression of HSP101B may be downregulated by partial methylation of the HSP101B sequence between the TIRs of the associated MULE.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».