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Enregistrement W2114969488 · doi:10.1094/phyto-11-13-0321-r

Long-Term Induction of Defense Gene Expression in Potato by <i>Pseudomonas</i> sp. LBUM223 and <i>Streptomyces scabies</i>

2014· article· en· W2114969488 sur OpenAlexafffund
Tanya Arseneault, Corné M. J. Pieterse, Maxime Gérin-Ouellet, Claudia Goyer, Martin Filion

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensUniversité de MonctonAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNew Brunswick Innovation FoundationUniversité de Moncton
Mots-clésCommon scabBiologyJasmonic acidDownregulation and upregulationGeneMicrobiologyMutantGene expressionSalicylic acidStreptomycesGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Streptomyces scabies is a causal agent of common scab of potato, which generates necrotic tuber lesions. We have previously demonstrated that inoculation of potato plants with phenazine-1-carboxylic acid (PCA)- producing Pseudomonas sp. LBUM223 could significantly reduce common scab symptoms. In the present study, we investigated whether LBUM223 or an isogenic phzC- mutant not producing PCA could elicit an induced systemic resistance response in potato. The expression of eight defense-related genes (salicylic acid [SA]-related ChtA, PR-1b, PR-2, and PR-5; and jasmonic acid and ethylene-related LOX, PIN2, PAL-2, and ERF3) was quantified using newly developed TaqMan reverse-transcription quantitative polymerase chain reaction assays in 5- and 10-week-old potted potato plants. Although only wild-type LBUM223 was capable of significantly reducing common scab symptoms, the presence of both LBUM223 and its PCA-deficient mutant were equally able to upregulate the expression of LOX and PR-5. The presence of S. scabies overexpressed all SA-related genes. This indicates that (i) upregulation of potato defense-related genes by LBUM223 is unlikely to contribute to common scab's control and (ii) LBUM223's capacity to produce PCA is not involved in this upregulation. These results suggest that a direct interaction occurring between S. scabies and PCA-producing LBUM223 is more likely involved in controlling common scab development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,377
Score d'incertitude au seuil0,220

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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