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Enregistrement W2115206903 · doi:10.1093/carcin/bgu038

HPV-associated lung cancers: an international pooled analysis

2014· article· en· W2115206903 sur OpenAlexaff
Camille Ragin, Monisola A. Obikoya-Malomo, S. Kim, Z. Chen, Rafael E. Flores‐Obando, Denise Gibbs, Chihaya Koriyama, Felipe I. Aguayo, Jill Koshiol, Neil E. Caporaso, Giovanna Elisiana Carpagnano, Marco Ciotti, Hirotoshi Dosaka‐Akita, Masashi Fukayama, Akiteru Goto, Demetrios�� Spandidos, Vassilis G. Gorgoulis, Daniëlle A.M. Heideman, Robert A. A. van Boerdonk, Kenzo Hiroshima, Reika Iwakawa, N G Kastrinakis, Ichiro Kinoshita, Suminori Akiba, M. T. Landi, H. Eugene Liu, Jianliu Wang, Ranee Mehra, Fadlo R. Khuri, Wan‐Teck Lim, Taofeek K. Owonikoko, Suresh S. Ramalingam, E. Sarchianaki, Karí Syrjänen, Ming‐Sound Tsao, Jenna Sykes, Siew Wan Hee, Jun Yokota, Apostolos Zaravinos, Emanuela Taioli

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésLung cancerMedicineOdds ratioInternal medicineConfidence intervalCervical cancerLungOncologyCancerDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human papillomavirus (HPV) is the etiologic risk factor for cervical cancer. Some studies have suggested an association with a subset of lung tumors, but the etiologic link has not been firmly established. We performed an international pooled analysis of cross-sectional studies (27 datasets, n = 3249 patients) to evaluate HPV DNA prevalence in lung cancer and to investigate viral presence according to clinical and demographic characteristics. HPV16/18 were the most commonly detected, but with substantial variation in viral prevalence between geographic regions. The highest prevalence of HPV16/18 was observed in South and Central America, followed by Asia, North America and Europe (adjusted prevalence rates = 22, 5, 4 and 3%, respectively). Higher HPV16 prevalence was noted in each geographic region compared with HPV18, except in North America. HPV16/18-positive lung cancer was less likely observed among White race (adjusted odds ratio [OR] = 0.33, 95% confidence interval [CI] = 0.12-0.90), whereas no associations were observed with gender, smoking history, age, histology or stage. Comparisons between tumor and normal lung tissue show that HPV was more likely to be present in lung cancer rather than normal lung tissues (OR = 3.86, 95% CI = 2.87-5.19). Among a subset of patients with HPV16-positive tumors, integration was primarily among female patients (93%, 13/14), while the physical status in male cases (N = 14) was inconsistent. Our findings confirm that HPV DNA is present in a small fraction of lung tumors, with large geographic variations. Further comprehensive analysis is needed to assess whether this association reflects a causal relationship.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,068

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,025
Bibliométrie0,0050,007
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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