Rusted Root of Ginseng (<i>Panax quinquefolius</i>) Is Caused by a Species of <i>Rhexocercosporidium</i>
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Rusted root (also known as rusty root) of ginseng (Panax quinquefolius) was first described over 70 years ago, but the causal agent has not been clearly established. The disease is characterized by slightly raised reddish-brown to black root lesions of varying size. The lesions, regardless of size, remain superficial; however, peridermal tissue is ruptured and sloughed off, giving the root a scabbed appearance. Culture-independent techniques were used to demonstrate that a fungal internal transcribed spacer (ITS) region DNA fragment was strongly associated with diseased but not healthy root tissue. The fragment ( approximately 650 bp in length) was cloned. Restriction enzyme digests of cloned DNA indicated that the 650-bp fragment represented a single taxon. BLAST analysis following sequencing of the fragment found that the nearest matches in GenBank were anamorphic genera associated with discomycetes, in particular Rhexocercosporidium spp. This putative identification was supported further by isolating fungi from diseased tissue using a semiselective agar medium. With this procedure, a Rhexocercosporidium-like fungus was isolated; DNA extracted from fungal cultures and amplified using ITS oligonucleotide primers was found to be identical to similarly amplified DNA from the 650-bp bands. However, the isolates were distinct, with respect to growth rate on agar media and ITS sequence, from Rhexocercosporidium carotae, the only described species in this genus. The ability to reproduce symptoms on ginseng roots was confirmed in pathogenicity tests. Oligonucleotide primers based on ITS sequences were designed to amplify DNA of Rhexocercosporidium spp. Polymerase chain reaction assays on DNA extracted from naturally infected root tissue showed that the fungus was present in nearly all symptomatic roots but was infrequent in healthy-appearing roots. The most probable cause of rusted root of ginseng is a previously undescribed species of Rhexocercosporidium.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».