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Enregistrement W2115286110 · doi:10.1095/biolreprod.108.067686

Identification of Potential Markers of Oocyte Competence Expressed in Bovine Cumulus Cells Matured with Follicle-Stimulating Hormone and/or Phorbol Myristate Acetate In Vitro

2008· article· en· W2115286110 sur OpenAlexaff
Mourad Assidi, Isabelle Dufort, Atef Ali, Mélanie Hamel, Omran Algriany, Steph Dielemann, Marc‐André Sirard

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOocyteBiologyBlastocystAndrologyIn vitro maturationEndocrinologyCell biologyEmbryoEmbryogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oocyte competence is the ability of the oocyte to complete maturation, undergo successful fertilization, and reach the blastocyst stage. Cumulus cells are indispensable for this process. Their removal significantly affects the blastocyst rates. Moreover, the properties and functions of cumulus cells are regulated by the oocyte. They also reflect the oocyte's degree of maturation. Our study was aimed at identifying markers of oocyte competence that are expressed in bovine cumulus cells. In a previous study in our laboratory, the blastocyst yield following FSH or phorbol myristate acetate (PMA) treatment was 45%%. Therefore, we tested four sets of conditions during the first 6 h of in vitro maturation (IVM): FSH (0.1 microg/ml), PMA (0.1 microM), FSH ++ PMA, and negative control. Extracts from each IVM treatment were hybridized against the same negative control on a microarray containing a partial library of differentially expressed transcripts in the cumulus of competent oocytes collected at 6 h after LH in vivo. Common positive clones between diffrentially treated cells were selected, and 15 candidates were validated by real-time PCR. Based on this, the main candidates expressed in cumulus cells and that could be valuable and indirect markers of oocyte competence are hyaluronan synthase 2 (HAS2), inhibin betaA (INHBA), epidermal growth factor receptor (EGFR), gremlin 1 (GREM1), betacellulin (BTC), CD44, tumor necrosis factor-induced protein 6 (TNFAIP6), and prostaglandin-endoperoxide synthase 2 (PTGS2). These biomarkers could be potential candidates to predict oocyte competence and to select higher-quality embryos for transfer. Additionally, these indirect predictors of oocyte competence and follicular health could improve our knowledge of gene expression patterns in the cumulus and yield insights into the molecular pathways controlling oocyte competence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations210
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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