Contribution of <i>Archaea</i> to Total Prokaryotic Production in the Deep Atlantic Ocean
Notice bibliographique
Résumé
Fluorescence in situ hybridization (FISH) in combination with polynucleotide probes revealed that the two major groups of planktonic Archaea (Crenarchaeota and Euryarchaeota) exhibit a different distribution pattern in the water column of the Pacific subtropical gyre and in the Antarctic Circumpolar Current system. While Euryarchaeota were found to be more dominant in nearsurface waters, Crenarchaeota were relatively more abundant in the mesopelagic and bathypelagic waters. We determined the abundance of archaea in the mesopelagic and bathypelagic North Atlantic along a south-north transect of more than 4,000 km. Using an improved catalyzed reporter deposition-FISH (CARD-FISH) method and specific oligonucleotide probes, we found that archaea were consistently more abundant than bacteria below a 100-m depth. Combining microautoradiography with CARD-FISH revealed a high fraction of metabolically active cells in the deep ocean. Even at a 3,000-m depth, about 16% of the bacteria were taking up leucine. The percentage of Euryarchaeota and Crenarchaeaota taking up leucine did not follow a specific trend, with depths ranging from 6 to 35% and 3 to 18%, respectively. The fraction of Crenarchaeota taking up inorganic carbon increased with depth, while Euryarchaeota taking up inorganic carbon decreased from 200 m to 3,000 m in depth. The ability of archaea to take up inorganic carbon was used as a proxy to estimate archaeal cell production and to compare this archaeal production with total prokaryotic production measured via leucine incorporation. We estimate that archaeal production in the mesopelagic and bathypelagic North Atlantic contributes between 13 to 27% to the total prokaryotic production in the oxygen minimum layer and 41 to 84% in the Labrador Sea Water, declining to 10 to 20% in the North Atlantic Deep Water. Thus, planktonic archaea are actively growing in the dark ocean although at lower growth rates than bacteria and might play a significant role in the oceanic carbon cycle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».